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地黄品种遗传多样性RAPD分析
用CTAB法提取10个地黄品种幼叶的.基因组DNA,用紫外分析法和琼脂糖凝胶电泳方法检测基因组DNA的纯度、大小和浓度.结果表明,从80条RAPD引物中分别筛选出适合于地黄RAPD标记分析的引物17条.17条RAPD引物对10个地黄品种(系)扩增出177条带,多态条带比率(PPB)为61.58%,平均多样性指数(I)为0.3135,遗传相似系数(GS)在0.63~0.93,平均GS为0.7545.RAPD标记的聚类分析结果,将10个地黄品种分为2类:第1类含有6个品种,包括组培85-5、大田85-5、组培9302、金白地黄、金状元和大田9302;第2类含有4个品种,包括北京1号、大红袍、地黄9104和野生地黄.
作 者:张进忠 王永芬 王建波 ZHANG Jin-zhong WANG Yong-fen WANG Jian-bo 作者单位:张进忠,ZHANG Jin-zhong(武汉大学生命科学学院,湖北,武汉,430072;河南职工医学院,河南,郑州,450003)王永芬,WANG Yong-fen(郑州牧业工程高等专科学校,河南,郑州,450011)
王建波,WANG Jian-bo(武汉大学生命科学学院,湖北,武汉,430072)
刊 名:河南农业科学 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF HENAN AGRICULTURAL SCIENCES 年,卷(期): “”(6) 分类号:S567.23 关键词:地黄 RAPD标记 遗传多样性 聚类分析怀地黄85-5品种内遗传多样性的RAPD和ISSR分析
采用CTAB法提取了怀地黄85-5品种16个单株的基因组DNA,使用紫外分析和琼脂糖凝胶电泳检测其纯度和大小,利用RAPD及ISSR分析其品种内遗传多样性.从24个RAPD引物和43个ISSR引物中分别筛选出具有稳定多态性条带的RAPD引物3个和ISSR引物2个,分别对16个单株基因组DNA进行PCR扩增.3个RAPD引物共扩增出7条带,其中多态性条带为4个,多态性比率为57.14%.2个ISSR引物共扩增出17条带,其中多态性条带为11个,多态性比率为64.7%.结果表明,怀地黄85-5品种内存在遗传差异,但遗传多样性比地黄品种间的低.
作 者:周延清 牛敬媛 田苗苗 李振勇 崔天星 邵大晓 李丙亮 冯艳铭 李智涛 李争 王天亮 范喜梅 李敏 申远 作者单位:周延清,牛敬媛,田苗苗,李敏,申远(河南师范大学,生命科学院,河南,新乡,453007)李振勇,崔天星,邵大晓,李丙亮,冯艳铭,李智涛,李争(华美生物工程公司,河南,洛阳,471003)
王天亮(温县农业科学研究所,河南,温县,454881)
范喜梅(焦作师范高等专科学校,河南,焦作,454000)
刊 名:河南师范大学学报(自然科学版) ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF HENAN NORMAL UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE) 年,卷(期):2006 34(3) 分类号:Q341 关键词:怀地黄 RAPD ISSR 遗传多样性朱砂根群体遗传多样性RAPD分析
在对朱砂根形态变异系统观测的基础上,进一步采用RAPD标记技术在DNA水平上对其种内遗传多态性进行检测.结果表明,朱砂根5个群体平均等位基因数A为1.8052,有效等位基因数Ne为1.4600,Nei氏基因多样度H为0.2699,Shannon多样性指数I为0.4067.总的群体基因多样性达0.2706,其中群体间的基因多样性Dst为0.0894,群体内的基因多样性Hs达0.1812,群体内的.基因多样性高于群体间的基因多样性.说明朱砂根群体间和群体内均存在着丰富的遗传变异,并以后者为主要变异来源.检测结果还表明,15个样本并不足以代表一个群体的遗传多样性,30个样本所代表的群体,其遗传多样性参数则相对一致和稳定.
作 者:江香梅 温强 叶金山 江梅 JIANG Xiang-mei WEN Qiang YE Jin-shan JIANG Mei 作者单位:江香梅,JIANG Xiang-mei(江西省林业科学院,省植物生物技术重点实验室,江西,南昌,330032;宁波江南现代农业高新技术研究院,浙江,宁波,315806)温强,叶金山,江梅,WEN Qiang,YE Jin-shan,JIANG Mei(江西省林业科学院,省植物生物技术重点实验室,江西,南昌,330032)
刊 名:江西农业大学学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS JIANGXIENSIS 年,卷(期): 28(5) 分类号:Q94 关键词:朱砂根 遗传多样性 RAPD分析光裸星虫遗传多样性的RAPD分析
采用12个随机引物对北海、三亚、厦门地区的`光裸星虫进行RAPD分析,结果表明,光裸星虫北海、厦门、三亚种群平均多态位点比例分别为73.39%、84.20%和87.00%,平均遗传多样性指数分别为0.245 0、0.295 8和0.267 0.北海种群和三亚种群遗传距离(Dbs)为0.122 5;北海种群与厦门种群的遗传距离(Dbx)为0.294 7;三亚种群与厦门种群的遗传距离(Dsx)为0.219 3.在聚类分析树上,厦门种群最先从聚类树上分支出来.OPH-02880和OPO-09-510为厦门种群的特征性片段,可作为种群鉴别的依据.
作 者:王庆恒 杜晓东 李康 WANG Qing-heng DU Xiao-dong LI Kang 作者单位:广东海洋大学海洋生物系,湛江,524088 刊 名:海洋水产研究 ISTIC PKU英文刊名:MARINE FISHERIES RESEARCH 年,卷(期):2006 27(3) 分类号:Q959.197 关键词:光裸星虫 遗传多样性 RAPD长江下游鳊鱼遗传多样性的RAPD分析
应用RAPD技术对长江下游鳊鱼群体的`遗传多样性进行分析,从40个随机引物中筛选出28个引物对鳊鱼24个个体的基因组DNA进行扩增,共检测到178个位点,分子片段在0.2~2.0 kb之间,其中多态位点83个,占46.63%:个体间最大的遗传距离为0.1326,最小的遗传距离为0.047 6,平均遗传距离为0.088 5;群体的Nei基因多样性指数为0.259 3,Shannon多样性指值为0.098 6.与其他鱼类的遗传多样性研究结果相比,长江下游鳊鱼群体的遗传多样性处于中等水平.
作 者:李建林 俞菊华 唐永凯 LI Jian-lin YU Ju-hua TANG Yong-kai 作者单位:中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室,江苏,无锡,214081 刊 名:广东海洋大学学报 ISTIC英文刊名:JOURNAL OF GUANGDONG OCEAN UNIVERSITY 年,卷(期): 28(1) 分类号:Q959.468 关键词:鳊鱼 遗传多样性 RAPD 长江大豆疫霉菌遗传多样性的RAPD分析
利用随机扩增DNA(RAPD)技术分析了15个大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)的遗传多样性,并同其它7个疫霉种的8个菌株进行了比较.运用筛选出的12个引物共获得152个RAPD标记,其中84.2%具有多态性.通过聚类分析结果表明,疫霉属种间的遗传相似系数的.变化幅度为0.533~0.783,大豆疫霉菌与其它几种疫霉的遗传距离相对较远,用引物OPB06扩增到P.sojae种特有的一个RAPD标记;P.sojae种内菌株间遗传相似系数的变化幅度为0.855~0.967,亦存在较丰富的遗传多样性,该遗传多样性与菌株毒力之间有一定相关性,而与菌株地理来源没有相关性.
作 者:陈宏宇 文景芝 CHEN Hong-yu WEN Jing-zhi 作者单位:东北农业大学农学院植保系,黑龙江,哈尔滨150030 刊 名:中国油料作物学报 ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF OIL CROP SCIENCES 年,卷(期): 28(3) 分类号:Q939.96 关键词:大豆疫霉菌 RAPD标记 遗传多样性 菌株毒力莲品种资源的SRAP遗传多样性分析
利用分子标记SRAP技术对国内广泛栽培以及新近育成的39个莲品种进行了DNA多态性分析.选取5对引物扩增基因组DNA,共获得101条带,其中88条为多态性条带,每对引物平均提供20个标记信息.由UPMGA方法得到的聚类分析结果表明了39个品种间的遗传关系,结果表明:花莲、籽莲和藕莲三大类群有明显的`界限,花莲和籽莲的遗传距离较近,藕莲与它们的遗传距离较远.分子方差分析结果表明:莲品种间和品种内均存在遗传变异,藕莲品种内的遗传变异略低于品种间的遗传变异,而诱变籽莲、诱变花莲和常规籽莲品种内遗传变异均大于品种间的遗传变异,尤其是诱变籽莲、诱变花莲品种内遗传变异占总变异的分量分别超过了70%和60%,这种品种内的遗传变异,一方面对于莲的高产稳产具有重要的意义,另一方面也说明了从这些国内广泛栽培的品种以及新近育成的莲品种中可以直接进一步选育出更优良的新品种.
作 者:瞿桢 魏英辉 李大威 肖丽舟 徐金星 谢克强 周明全 胡中立 QU Zhen WEI Ying-Hui LI Da-Wei XIAO Li-Zhou XU Jin-Xing XIE Ke-Qiang ZHOU Ming-Quan HU Zhong-Li 作者单位:瞿桢,周明全,胡中立,QU Zhen,ZHOU Ming-Quan,HU Zhong-Li(武汉大学莲藕研究中心,武汉,430072)魏英辉,WEI Ying-Hui(福建省建宁县莲子科学研究所,福建建宁,354500)
李大威,肖丽舟,LI Da-Wei,XIAO Li-Zhou(长江大学农学院,湖北荆州,434023)
徐金星,谢克强,XU Jin-Xing,XIE Ke-Qiang(江西省广昌县白莲科研所,江西广昌,344900)
刊 名:氨基酸和生物资源 ISTIC英文刊名:AMINO ACIDS AND BIOTIC RESOURCES 年,卷(期): 30(3) 分类号:Q3 关键词:莲 SRAP 亲缘关系樱桃品种资源间遗传差异的RAPD分析
以来自欧洲甜樱桃(Prunus avium)和中国樱桃(Prunuspseudocerasus)的11份品种资源为试材,用34个随机引物对这些种质间的RAPD多态性进行了分析.除了S1090外,几乎所有的引物均能将欧洲甜樱桃品种和中国樱桃品种区分开来.用11个能在甜樱桃品种间表现多态性的引物所产生的101个位点进行相似系数的计算和聚类分析,结果将供试种质划分为两大组群:中国樱桃组群和甜樱桃组群,其中甜樱桃组群又可分为两个亚组.这一研究结果对了解这些种质的`遗传差异程度,从而有目的地拓宽育种材料的遗传背景和在育种过程中创造出较大幅度的遗传变异有重要意义.
作 者:王彩虹 田义轲 赵静 戴洪义 王东 WANG Cai-hong TIAN Yi-ke ZHAO Jing DAI Hong-yi WANG Dong 作者单位:王彩虹,田义轲,赵静,戴洪义,WANG Cai-hong,TIAN Yi-ke,ZHAO Jing,DAI Hong-yi(莱阳农学院园艺系,山东,青岛,266109)王东,WANG Dong(西北大学化学系国家基地班,西安,710069)
刊 名:西北植物学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA BOTANICA BOREALI-OCCIDENTALIA SINICA 年,卷(期): 25(12) 分类号:Q346+.5 S662.1 关键词:樱桃品种 RAPD标记 遗传差异 聚类分析利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性
利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、阳城白山羊、新疆南疆山羊、新疆北疆山羊以及宁夏中卫山羊6个地方山羊品种的分子水平上的.遗传多样性,结果表明:19个微卫星位点均为中度和高度多态位点,平均多态信息含量(PIC)达0.6859~0.7083;6个品种平均位点杂合度在0.3832~0.4277之间.遗传分化系数表明:BM203、BM023、BMS6526和BM875 4个位点的遗传分化系数(GST)估算值较大,分别为0.0475、0.0491、0.0107和0.0262,BM3033值最小,为0,表明前4个位点在不同品种间的基因分化占总群杂合度的4.75%、4.91%、1.07%和2.6%;其它位点遗传分化系数(GST)值不高,遗传变异主要存在于各个品种内,品种间遗传变异不大.以Nei氏标准遗传距离的UPGMA和N-J聚类结果表明,吕梁黑山羊与阳城白山羊具有较近的亲缘关系,黎城大青羊与新疆南疆山羊具有较近的亲缘关系;以共祖距离的UPGMA和N-J聚类结果,阳城白山羊与新疆南疆山羊亲缘关系较近,山西地方山羊与新疆山羊有可能存在一定的基因交流.
作 者:张爱玲 马月辉 李宏滨 关伟军 浦亚斌 张英汉 陈宏 赵倩君 何晓红 ZHANG Ai-Ling MA Yue-Hui LI Hong-Bin GUAN Wei-jun PU Ya-Bin ZHANG Ying-Han CHEN Hong ZHAO Qian-Jun HE Xiao-Hong 作者单位:张爱玲,ZHANG Ai-Ling(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094;西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)马月辉,李宏滨,关伟军,浦亚斌,赵倩君,何晓红,MA Yue-Hui,LI Hong-Bin,GUAN Wei-jun,PU Ya-Bin,ZHAO Qian-Jun,HE Xiao-Hong(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)
张英汉,陈宏,ZHANG Ying-Han,CHEN Hong(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)
刊 名:农业生物技术学报 ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 14(1) 分类号:S181 S188 关键词:山羊 微卫星 遗传多样性 系统发生 遗传分化系数SSR标记对籼稻品种的遗传多样性分析
利用500多对SSR标记对广陆矮4号、珍汕97B、佳辐占、明恢86和明恢63 5个籼稻亲本品种进行遗传多样性分析.结果表明,佳辐占与明恢63、明恢86、珍汕97B和广陆矮4号之间的相似系数分别为78.1%、76.1%、72.8%和71.7%.相对而言,其相似系数越小,遗传距离越大,因此利用佳辐占与这些品种组配较有希望选育出品质优良、综合优势明显的'新品系.同时研究表明,标记间平均距离为10 cM或小于10 cM时,分析所得结果较为可靠.
作 者:黄建勋 张凯 江良荣 黄育民 王侯聪 HUANG Jian-xun ZHANG Kai JIANG Liang-rong HUANG Yu-min WANG Hou-cong 作者单位:厦门大学生命科学学院,福建,厦门,361005 刊 名:厦门大学学报(自然科学版) ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF XIAMEN UNIVERSITY (NATURAL SCIENCE) 年,卷(期):2006 45(1) 分类号:Q949 关键词:水稻 微卫星标记 遗传多样性 相似系数