以下是小编整理的《生物信息学》读后感（共含16篇），欢迎阅读与收藏。同时，但愿您也能像本文投稿人“金小秀”一样，积极向本站投稿分享好文章。
《生物信息学》读后感
写在前面：
樊老师的书买了好久了，一直没有时间看，最近花了几天时间把它看完了。看完后决定写点什么。书评没资格写，读书笔记也不够系统，就打算写个读后感。
樊老师这本书是本学术著作，有很多干货，也有很多值得分享的东西，但是由于这篇文章并非读书笔记，而仅仅是一篇读后感，所以更多的集中于定义、意义、前景等东西，定位为科普性质的文章。
我怎么遇到樊老师和他的书
夏秋之际我参加了一个生信培训班，樊老师作为主讲老师之一，作为生信小白有幸接触到樊老师和其他几位大牛真是三生有幸。那时候樊老师的新书刚刚出版，他向我们推荐了他的书，使我们不仅以优惠价买到了，还得到了老师的亲笔签名和合照，也算是捡了个大便宜。
人类基因测序：
人类基因组计划由六个国家花时间30亿美金完成的，无论是时间还是经费都是我们不可想象的巨量。但是目前我们已经可以用1000美元对人的基因组进行测序，有公司甚至放话：20xx实现100美金的基因组测序。你可以想象吗用1000或几千人民币测我们的所有基因。如此低廉的成本，允许我们对自己的知道自己的基因图谱，当我们获得自己的基因编码（这一个决定我们作为一个生命体的所有特征的信息）之后，我们能干什么：编辑自己的基因，预防癌症，延长寿命等等，可能无限多。这也是为什么当初各国愿意花巨资和大量的人力物力去完成基因组计划。
生物信息学：生物学与信息学：
生物信息学虽然目前大多集中于核酸领域或者分子领域，但是这个术语的一般意义是研究生物信息的采集、处理、存储、传播、分析和解释等个方面的科学（《生物信息学-樊龙江》）。而生物信息学的目的则是，把生物体当做一个系统，通过信息学的方法，加深对生物学过程的认知。
因此总得来说，生物信息学是用使用信息技术处理生物学问题。为什么它很重要？由于高通量测序方法的'普及、测序成本的降低，使得普通人或者其他物种的基因组测序成为可能；再加上医院等医疗机构数字系统的普及和完善，我们积累了大量的关于医疗或者生命健康的数据，其中蕴含着大量的价值，需要用生物信息学的方法来挖掘、分析处理。
21世纪是生物信息学的世纪：
一直在说：21世纪是生物的世纪。可是我在知乎等领域看到了一大片的生物劝退言论，为什么？因为生物的世纪还没到，可能是21世纪的中后期才到。但是它的曙光已经出现，现在的光已经更加强烈，生物的太阳随时可能闪现到我们头顶。
那么什么会催化生物学的繁荣和到来呢？私以为是生物信息学。如果方向正确、方法得当，生物信息学可以帮助我们破解生命编码的秘密，我们会获得大量的医疗健康知识，使得完全解开生命的奥秘、精准医药的实现等成为可能。
可以说21世纪是生物的世纪，也是生物信息学的世纪。
生物信息学进展浅析
生物信息学是80年代以来新兴的一门边缘学科,信息在其中具有广阔的前景.伴随着人类基因组计划的胜利完成与生物信息学的发展有着密不可分的`联系,生物信息学的发展为生命科学的发展为生命科学的研究带来了诸多的便利,对此作了简单的分析.
作 者：黎才俊 作者单位：长江大学生命科学学院,湖北,荆州,434025 刊 名：硅谷 英文刊名：SILICON VALLEY 年，卷(期)： “”(10) 分类号：Q1-0 关键词：生物信息学 生命科学生物信息学研究进展
随着生物科学和计算机科学的迅猛发展,由此而诞生的生物信息学逐渐发展成为一门独立的'学科.本文简单介绍了生物信息学的近几年来的一些主要数据库,应用前景,面临的挑战.
作 者：刁雪涛 张小芳 宋洁 金梅 作者单位：辽宁师范大学生命科学学院,辽宁,大连,116029 刊 名：安徽农学通报 英文刊名：ANHUI AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN 年，卷(期)：2008 14(22) 分类号：Q522 关键词：生物信息学 数据库 查询工资待遇
截止到 12月24日，37302位生物信息学专业毕业生的平均薪资为4717元，其中0-2年工资4999元，3-5年工资4999元，应届毕业生工资4999元。
就业方向
生物信息学专业学生毕业后可在各级生物信息学的研究机构、高等学校、企事业单位以及在研究和成果产业化过程中涉及到生物信息学的相关部门，从事科学研究、教学和管理工作
就业岗位
销售代表、医药代表、销售工程师、销售经理、区域销售经理、临床医药代表、医疗器械销售代表、销售助理、医疗器械销售人员、销售专员、销售主管、招商经理等。
城市就业指数
生物信息学专业就业岗位最多的地区是上海。薪酬最高的地区是上海。
就业岗位比较多的城市有：上海[1450个]、北京[1380个]、广州[796个]、南京[399个]、武汉[389个]、深圳[388个]、杭州[333个]、成都[242个]、苏州[206个]、西安[193个]等。
就业薪酬比较高的城市有：上海[5665元]、天津[4999元]、无锡[3000元]、杭州[2999元]等。
同类专业排名
生物信息学专业在专业学科中属于理学类中的生物科学类，其中生物科学类共12个专业，生物信息学专业在生物科学类专业中排名第2，在整个理学大类中排名第8位。
在生物科学类专业中，就业前景比较好的专业有：医学信息学，生物信息学，生物化学与分子生物学，生物技术，生物安全，动物生物技术，生物科学，生物信息技术，植物生物技术等。
生物信息学学术期刊评价
学术期刊的评价包括核心期刊的`界定和新创刊的评价.以知识密度梯度的概念和期刊论文分布特征相结合确定了30种生物信息学中文核心期刊,以影响权重、声誉系数和H指数对新创刊的生物信息学中文期刊进行了评价.
作 者：顾东蕾 Gu Dong-lei 作者单位：中国药科大学图书馆,江苏,南京,210009 刊 名：中华医学图书情报杂志 英文刊名：CHINESE JOURNAL OF MEDICAL LIBRARY AND INFORMATION SCIENCE 年，卷(期)： 18(4) 分类号：Q811.4 G255.2 关键词：生物信息学 期刊评价 知识密度梯度 核心期刊 学术期刊生物信息学开题报告
1.课题研究的目标
生物技术药物(biotech drugs)又称为生物药物(biopharmaceu—tics)。它是以生物信息学、功能抗原学、组合化学等高科技作为依托，融合了医学、生物学、药物学等先进技术，依靠突破分子生物、生物物理、分子遗传学等基础学科而形成的产业。当今，世界生物制药技术产业正处于投资收获期，得到了迅速发展。生物技术药品在医药、曰化产品、保健食品等领域得到广泛的应用。特别是在改造传统制药产业发挥重要作用，它在新药物的开发研究和生产过程中广泛的运用，现代生物制药技术成为当今最为重要的技术之一
2.国内外研究现状(文献综述)：
很多学者认为，20世纪占主导地位的科学技术是物理学和化学这两大学科。但21世纪占主导的科学技术是依赖生物学的成就。生物技术是当前高新技术中发展最为迅速的领域。依照当前的速度，生命科学这一学科到201 5年将会得革命性突破。它的发展将帮助人类解决很多当前无法人类疾病，同时还可以改革食品的生产过程，彻底消除人类的营养不良。这些将极大的延长人类寿命，改善人们的生活。
一、国际上生物制药的发展现状
1.1生物技术在制药工艺中的应用
其一，应用基因工程技术研制和开发药物。自20世纪70年代初蛆来，基因工程药物发展十分迅速，基因制各技术、宿主表达系统及细胞反应器均有较大进步。如中国地鼠卵细胞，c127细胞及弥猴细胞等。
其二，细胞工程、酶工程、发酵工程、应用细菌工程技术已培养成功了多种萄类中草药，如冬虫夏草、灵芝等，使一些名贵的中草药可以用发酵的方法牛产出来。一些重要的基斟工程生产的酶，已被用于药物中问体的酶促转化，发酵工程也为医药工业提供了新的生产工艺。第三，生物纳米技术在医药中的应用。如用纳米材料制备药物的载体;制各纳米级药物;纳米技术在中药现代化中的应用，“纳米中药”中仪可以提高药物的生物利用度，还能降低毒副作用，增强临床疗效，易被人体吸收。
1.2建立药物筛选新模型
随着分子水平的药物筛选模型的出现，筛选方法和技术都发生了根本性的变化，出现了高通量筛选的新技术，在短时间内即可完成庞大数量化的化合物活性筛选，大大加速了新药的寻找和发现。并且可以利用基因敲除或转基因技术，可以建立基因缺乏或基因转入的动物或细胞系，将其作为药物研究的病理模型，对药物的作用进行试验，将对新药研究产生重大的作用。
1 3创建药理、毒理研究的新模型与新方法
通过基因及基因结构功能研究、蛋白质组织及蛋白质结构功能研究，科学地评价药物疗效和毒性，研究药物的代谢和信号传导途径，可必为药理、毒理研究创建新的模型和新的方法。
1.4完善药物研制和药的治疗
随着20世纪90年代韧启动的人类基因组计划的实施和实现，人类遗传密码将被解析，基因结构、功能研究的`深入，必然会找H1一些与疾病有关的基崮，这些基因可以成为研究药物的新靶点，或以这些基因为基础建立药物筛选的新模型。这些模型不仅对从事分子水平的新药设计和研制有用，同样也可以用于化学合成药物的筛选和中草药有效成分的筛选等。
二、国内现状
我国生物制药产业起步较晚，经过了二十几年的发展，以基因工程药物为核心的研制、开发和产业化已经颇具规模。目前，全国注册的生物技术公司超过了300家，主要分布于环渤海、长三角、珠三角等经济发达的地区。近年来，我国开发出了一大批新的特效药物，解决了过去用常规方法不能生产或者生产成本特别昂贵的药品的生产技术问题。这些药品对肿瘤、心脑肺血管、免疫性、内分泌等严重威胁人类健康的疑难病症起到了较好的治疗效果，且副作用明显低于传统药品。肿瘤是多机制的复杂疾病，目前仍用早期诊断、放疗、化疗等综合手段治疗。如应用基因工程抗体抑制肿瘤，应用导向IL-2受体的融合毒素治疗CTCL肿瘤，应用基因治疗法治疗肿瘤(如应用干扰素基因治疗骨髓瘤)。基质金属蛋白酶可抑制肿瘤血管生长，阻止肿瘤生长与转移。与世界先进国家的生物医药产业相比，我国生物医药产业还处于比较落后的状态，但是国家和地方政府都在不断加大对该产业的发展扶持力度，从政策和资金等各方面不断加大投入。当前，我国已将生物制药作为经济发展的重点建设行业和高新技术的支柱产业来发展。不断建立国家级生物制药产业基地，并初步形成了初具规模的生物医药产业集群，这对我国的生物医药产业发展起到了很好的带动作用。
3.选题研究的内容：
该论题研究的内容主要是以下几个方面：
一、目前世界范围内生物制药的发展现状
二、我国发展生物制药的优势
三、我国发展生物制药的策略
4.选题研究的技术路线、研究方法和要解决的主要问题：
研究技术路线：首先，了解本论题的研究状况，形成文献综述和开题报告。其次，进一步搜集阅读资料并研读文本，做好相关的记录，形成论题提纲。第三，深入研究，写成初稿。最后，反复修改，完成定稿。
研究方法： 运用文献分析法、文本细读法、比较法、综合分析法等进行研究。
要解决的关键问题：
5.研究与写作计划：
20xx年3月8日——4月15日 确定选题、收集相关资料
20xx年4月16日——4月30日 撰写开题报告与开题
20xx年5月1日——6月30日 收集资料，开展研究，形成写作提纲
20xx年7月1日——9月30日 深入研究，形成论文初稿
20xx年10月1日——10月30日 论文修改、定稿、打印、答辩
生物信息学工程师个人简历
姓 名：大学生个人简历网
性 别： 女
出生年月： 1988年1月
工作经验： 应届毕业生
毕业年月： 7月
最高学历： 本科
毕业学院： 山东科技大学
所修专业： 基础数学
居 住 地： 山东省 青岛市 黄岛区
籍 贯： 山东省 淄博市 桓台县
求职概况 / 求职意向
职位类型： 全职
期望月薪： 5000-6000元
期望地点： 北京市 ，山东省 青岛市 ，山东省 济南市
期望职位： 生物信息学工程师 数据建模、统计 软件
意向概述： 我的研究方向是生物信息与智能计算，有丰富的系统生物学、生物信息学以及生物统计学方面的知识，可以熟练的使用matlab编写程序，熟练使用SAS、SPSS等统计软件处理海量数据。多次参加国内外的数学建模大赛，并获得非常好的.成绩，对数据建模有很强的优势，善于用数学知识解决实际问题。大学本科和研究生期间一直担任班级的班干部，有比较强的组织和领导能力，可以很好的领导和组织团体。
教育经历
时间 院校 专业 学历
9月 - 206月 山东科技大学 基础数学 硕士
9月 - 206月 山东科技大学 数学与应用数学 本科
工作经历/社会实践经历
时间 工作单位 职务
年7月 - 2010年9月 山东省淄博市桓台县马桥镇富康源消毒配送中心 财务
7月 - 207月 山东省淄博市桓台县马桥中学 数学老师
担任时间 职务名称 学校
209月 - 2010年6月 学习委员 信息科学与工程学院
2010年9月 - 年6月 党支部书记 研究生学院
自我评价
本人性格热情开朗、乐观向上，独立坚强、有毅力有韧性。为人诚实谦虚、待人友好，具有亲和力，平易近人，善于倾听别人。学习刻苦努力、成绩优异。工作认真负责、吃苦耐劳，多年的学生干部工作很好的锻炼了我的组织和与人沟通的能力。社会实践经历丰富，增加了自己的社会阅历，在工作中体会办事方式，锻炼了口才和人际交往能力。四年的大学生涯和两年的研究生生涯，让我的学习能力、组织协调能力、管理能力、应变能力等大大提升。
数学建模
多次参加“全国大学生数学建模带赛”、“美国数学建模大赛”、“全国研究生数学建模大赛”，其中参加美国大学生数学建模大赛并获得一等奖，20参加全国研究生数学建模大赛并获得三等奖。善于运用数学知识解决实际问题，简历一般性的模型。
科研方面
我的研究方向为：生物信息与智能计算，主要从事生物信息学的研究，以复杂网络和图论为基础，用各种数学知识研究各种疾病的致病机理，目前主要涉及的疾病是各种肿瘤，我自己做过研究的实例是脑瘤、肾癌、肺癌等，并已发表过多篇的学术论文。我独立申请并完成山东科技大学研究生创新基金项目：基因网络相继故障机理的探索研究,首先从全基因组出发,利用基因组的基因表达数据,建立网络,并应用相继故障原理,寻找疾病的致病机理,找
组织能力
本科期间一直担任班级学习委员、研究生期间一直担任班级党支部书记，有较强的组织协调能力、管理能力。
联系方式
电子邮箱：
手 机：
QQ/MSN：
作为参考范文。 姓名：大学生个人简历网 两年以上工作经验|男|26岁（1990年12月9日） 居住地：北京 电 话：137*******（手机） 最近工作[11个月] 公 司：XX有限公司 行 业：制药/生物工程 职 位：生物信息学分析工程师 最高学历 学 历：本科 专 业：生物信息学 学 校：清华大学 求职意向 到岗时间：可随时到岗 工作性质：全职 希望行业：制药/生物工程 目标地点：北京 期望月薪：面议/月 目标职能：生物信息学分析工程师 工作经验 /9 – /8：XX有限公司[11个月] 所属行业：制药/生物工程 服务部 生物信息学分析工程师 1. 揭示生物学处理后性状差异的机制，以及生理、病理机制等等； 2. 通过建立计算模型，筛选差异表达蛋白、代谢物或Biomarker； 3. 蛋白质功能注释； 4. 蛋白质相互作用网络分析； /5 – 2014/8：XX有限公司[1年3个月] 所属行业：制药/生物工程 服务部 生物信息学分析工程师 1. 建立蛋白质组学和代谢组学数据的生物信息学分析平台； 2. 为客户提供生物信息学分析的解决方案和建议； 3. 对实验产生的蛋白质组学和代谢组学数据进行生物信息学分析； 教育经历（本文由大学生个人简历网小篇为大家收集） /8— 2013/6 清华大学生物信息学 本科 证书 2010/12 大学英语四级 语言能力 英语（良好）听说（良好），读写（良好） 自我评价 工作投入，富有较强责任感，有耐心，做事有条理，认真细致；良好的文字和数据处理能力，积极好学，有上进心。具有较强的人际交往和处理突发事件的能力，可熟练使用基本办公软件，做事踏实严谨，思路开阔，执行力强乐于助人。
糖类的生物信息学资源
生物信息学在推动遗传学和蛋白质科学的研究领域中,已发挥了举足轻重的作用.相比较而言,糖科学产生的信息还比较有限,随着人们对糖类分子的关注,糖生物学的.发展也出现新的契机,其信息正在飞速地增长.对已经获得的糖类相关知识进行系统整合就显得越来越有必要,许多研究型数据库和免费工具已应运而生,并且数目在不断扩大,正成为科学工作者非常便利的工具.但到目前为止,许多数据库或者网络预测工具在文献中很少提及或难以找到,给研究者带来了不少的麻烦.部分原因是数据库资源本身数据不断在更新,人机界面也变得越方便和人性化,另外就是人们对于这些新型的研究工具了解较少.这篇综述介绍了目前网络上最常用的糖类生物信息学资源,包括糖的一级结构,分析测试数据、构象,酶,凝集素,糖蛋白等方面的各种数据库.
作 者：周永达 时春娟 张剑波 王克夷 汤杰 ZHOU Yong-Da SHI Chun-Juan ZHANG Jian-Bo WANG Ke-Yi TANG Jie 作者单位：周永达,时春娟,张剑波,汤杰,ZHOU Yong-Da,SHI Chun-Juan,ZHANG Jian-Bo,TANG Jie(华东师范大学化学系,上海,62)王克夷,WANG Ke-Yi(中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所,上海,200031)
刊 名：中国生物化学与分子生物学报 ISTIC PKU英文刊名：CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 年，卷(期)： 22(3) 分类号：Q53 Q811.4 关键词：糖数据库 糖生物学 糖组学 糖基化 糖蛋白我个人认为生物信息学就业前景不错!现在生物领域很多研究人员都在做测序(动物的、植物的、微生物的等等)，测序本身很简单，但是测序后的数据分析比较费神了，需要有生物信息学背景知识的人来做。
所以说这个专业前景比生物学其他专业要好些，其实其他领域也可以进去，因为本身这个专业要学些计算机方面的知识，一般都会编些程序什么的，个人能力比一般的生物学专业的学生要多些。
一是教育方向，大学老师是不错的选择;
二是企业，从车间的技术员，到研发员;
三是研究所、科学院等。其实生物就业很广，医药类、农畜类等都会涉及到。
关键词：生物信息学;现代教育技术;案例教学
人类基因组计划的成功实施使生命科学进入了信息时代。
基因组学、蛋白质组学和生物芯片 技术的发展，使得与生命科学相关的数据量呈线性高速增长。
对这些数据全面、正确的解读 ，为阐明生命的本质提供了可能。
连接生物数据与医学科学研究的是生物信息学(Bioinform atics)。
应用生物信息学研究方法分析生物数据，提出与疾病发生、发展相关的基因或基因 群，再进行实验验证，是一条高效的研究途经。
医学是研究生命的科学，医学研究在基础上 就注定离不开对生物信息的了解。
我国目前医学研究生教学模式主要有两种, 一是医学本科教育延续过来的理论型, 这种类型 的教育是在本科教学大纲的基础上, 按照教学计划进行理论讲授, 最后按照导师指定的课题 完成毕业论文。
这种培养模式突出理论学习, 忽视了实验机能和科研能力的培养。
二是科研 能力培养的前轻后重型, 前期只是进行理论授课, 后期由导师指导学生的科研。
这种模式虽 然开设了一定的实验项目, 但对研究生科研能力的培养缺乏系统性, 并且前期的培养不足直 接影响到研究生后期的学位课题和论文的进度、质量。
因此，笔者对生物信息学在医学硕士研究生中的教育初探，不但有利于该门课程尚未完全形 成成熟的课程体系之际，为教师学习借鉴先进的教育思想与教学实践经验，更有利于医学硕 士研究生对生物信息学的学习。
1 生物信息学的研究范围
生物信息学是一门新兴的交叉学科，涉及生物学、数学和信息科学等学科领域，并注定以互 联网为媒介，数据库为载体，利用数学知识、各种计算模型，并以计算机为工具，进行各种 生物信息分析，以理解海量分子数据中的生物学含义。
生物信息包括多种类型的数据，如核酸和蛋白质序列、蛋白质二级结构和三级结构的数据等 。
由实验获得的核酸蛋白序列和三维结构数据等构成初级数据，由此构建的数据库称初级数 据库。
由初级数据分析得来的诸如二级结构、疏水位点、结构域(Domain)，由核酸序列翻译 来的蛋白质以及预测的二级三级结构，称为二级数据。
创新算法和软件是生物信息学持续发 展的基础，高通量生物学研究方法和平台技术是验证生物信息学研究结果的关键技术。
因此 ，现代生物信息学是现代生命科学与信息科学、计算机科学、数学、统计学、物理学和化学 等学科相互渗透而形成的交叉学科，是应用计算机技术和信息论方法研究蛋白质及核酸序列 等各种生物信息的采集、存储、传递、检索、分析和解读，以帮助了解生物学和遗传学信息 的科学。
从其研究所涉及的学科上看，生物信息学是集生物学、数学、信息学和计算机科学 一体化的一门新的科学;从其研究的主要内容上看，基因组信息学、蛋白质的结构模拟以及 药物设计是生物信息学的三个重要组成部分，并有机地结合在一起[1]。
2.1 课堂教学重在教授实践技巧与方法
生物信息学在医学研究生中的教学应以教授实践技巧为主，以介绍原理为辅，深入浅出，注 重课堂知识与科研实践的紧密结合。
课堂讲授应简要介绍生物信息学的相关算法、原理，着 重介绍其使用技巧与方法，真正做到“有的放矢”，而这也是教学的重点和难点。
在教学中对于这部分内容应遵循深入浅出、避繁就简的原则，结合具体实例分析算法，避免 空洞复杂的算法讲解让学生觉得枯燥乏味、晦涩难懂，产生畏惧心理，知难而退;注重讲解 使用技巧与方法的思想和来龙去脉，让学生真正掌握解决问题的思路，培养其科学思维能力 ，并采用探讨式教学鼓励学生思考，通过讨论与研究的方式循序渐进的掌握复杂的内容，介 绍相关的教学和物理学知识，使学生充分体会到生物信息学与其他学科的关系，其他学科的 思想方法对于生物科学的重要性，培养其自觉地将其他学科的方法和思想应用于解决生物 学问题的科学素质。
任何学科都处于不断地发展、更新中，生物信息无论是理论研究还是 应用研究仍处于不断发展完善中，同时随着新的应用领域和新问题的发现，其他学科的方 法也在不断地应用于生物信息学，进一步增加了其多学科交叉融合的深度和广度。
2.2 充分利用现代化教育技术，采用案例教学
目前，高等院校在教室内配备的多媒体投影播放系统，促进了多媒体教学的广泛应用。
生物 信息学采用多媒体教学是适应学科特点、提高教学效果和充分利用现代化教育技术的一项基 本要求。
作为生物信息学教学的基本模式，多媒体教学使讲解的内容更加直观形象，尤其是 对于具体数据库的介绍以及数据库检索、数据库相似性搜索、序列分析和蛋白质结构预测等 内容涉及到的具体方法和工具的讲解，可以激发学生的学习兴趣，加深学生对知识的理解和 掌握，提高学生理论与实践相结合的能力。
但多媒体教室也有局限性，学生主要以听讲为主不能及时实践，教师讲解与学生实践相脱节 ，如果将生物信息学课程安排在计算机房内进行，并采用多媒体电子教室的教学方式可以解 决上述问题。
在教学中采用启发式教学，为学生建立教学情景，学生通过与教师、同学的'协 商讨论，参与操作，发现知识，理解知识并掌握知识。
例如在讲授“目的基因序列的查寻” 时，除对基本内容的介绍，如数据库的发展、分类等，其他采用案例法，让学生利用搜索工 具查找三大公共核酸数据库，并通过数据库网站的介绍内容对该数据库的发展、内容、特点 进行学习并总结，通过讨论和实际的数据库浏览操作了解三大公共核酸数据库并且掌握数据 库使用方法。
2.3 采用“讲、练”一体化的教学模式，强调学生实践能力的培养
生物信息学课堂教学积极学习借鉴职业培训和计算机课程教学中“讲、练、做”一体化的教 学模式，在理论教学中增加实训内容，在实践教学中结合理论讲授，改变了传统的“以教师 为中心、以教材和讲授为中心”教学方式。
根据教学内容和学生的认知规律，灵活地采用先理论后实践或先实践后理论或边理论边实践 的方法，融生物信息学理论教学与实践操作为一体，使学生的知识和能力得到同步、协调、综合发展。
通常采用先讲后练的方法，即首先介绍原理、方法，之后设计相关的实训内容 让学生上机实践。
对于操作性内容和生物信息分析的方法和工具的讲解采取了进行实际演示 的方法，教师边讲解边示范，学生在听课时边听讲边练习或者教师讲解结束后学生再进行练习，理论与实践高度结合，充分发挥课堂教学的生动性、直观性，加深学生对知识的理解， 培养和提高学生的实践操作能力。
2.4 发挥网络教学优势，优化生物信息学实验教学内容
生物信息学实验教学主要是针对海量生物数据处理与分析的实际需要，培养学生综合运用生 物信息学知识和方法进行生物信息提取、储存、处理、分析的能力，提高学生应用理论知识 解决问题的能力和独立思考、综合分析的能力。
生物信息学实验教学内容的选择与安排应按 照循序渐进的原则，针对特定的典型性的生物信息学问题设计，以综合性、设计性实验内容 为主，明确目的要求，突出重点，充分发挥学生的主观能动性和探索精神，以激发学生学习的主动性和创造性为出发点，加强学生创新精神和实验能力的培养。
生物信息学实验教学以 互联网为媒介、计算机为工具，全部在计算机网络实验室内完成。
在教学中，充分利用网络 的交互特点实现信息技术与课程的结合。
教师通过电子邮件将实验教学内容、实验序列、工 具等传递给学生，学生同样通过电子邮件将实验报告、作业、问题和意见等反馈给教师，教 师在网上批改实验报告后将成绩和评语发送给学生，让学生及时了解自己的学习情况。
生物信息实验教学与现代网络和信息技术密不可分，在教学工作中充分利用现代教育技术较 其他课程更具优势。
区别于其他生命科学课程，在教学过程中要求有发达的互联网和计算机 作为必备条件。
调查显示国内高校都已建立校园网，其中拥有1000 M主干带宽的高校已占调 查 总数的64.9%，一些综合类大学和理工类院校将率先升级到万兆校园网[2] ，这些都为生物信息学课程在高校开设提供了良好的物质基础。
2.5 考试无纸化，加强实践能力考核
考试重点是考查学生对生物信息分析的基本方法和技能的掌握程度和对结果的分析解释能力 。
因此，在生物信息学考试中尝试引入实践技能考试，重点考核学生知识应用能力。
实践技 能考试采用无纸化考试方式，学生在互联网环境下，对序列进行生物信息分析并对结果进行 解释，不仅考核学生对基本知识和基本原理的掌握，而且考查学生进行生物信息分析的实际 能力和分析思考能力。
通过实践技能考试，淡化理论考试，克服传统的死记硬背，促进学生 注重提高理论用于实践的综合能力，同时更有效地提高学生计算机应用能力。
除采用实践技 能考试并将其作为学生成绩的主要部分外，还加强了对学生平时学习态度、学习能力、创新 思维等方面的考核。
总之，生物信息学教学是网络环境下生物教学的全新内容。
通过上述教学措施，提高了学生 的 学习积极性、实践操作能力、解决实际问题的综合应用能力及创新能力，收到了良好的教学 效果，得到了学生的普遍欢迎，具有较强的可操作性和实践性。
在今后的教学实践中，随着 教师自身素质的提高和进一步的教学改革将会不断完善生物信息学教学，培养具有“大科学 ”素质和意识的医学研究生人才。
参考文献：
[1] 张阳德.生物信息学[M].北京：科学出版社，：4.
[2] 教育部科技发展中心.教育部科技发展中心对大学校园网建设应用状况 调查结果.千兆已成主流，应用全面渗透[J].中国教育网络，，5：36-39.
摘要：介绍了生物信息学专业教学的特点，分析了生物专业学生进行计算机课程教学中存在的问题，提出了生物专业计算机课程教学方法。
关键词：生物信息学;生物专业; 教学方法;学科交叉
Abstract： The characteristics of the professional teaching of bioinformatics are introduced ， then the paper analyzes on the professional students of biological problems existing in the teaching of computer， biological computer curriculum teaching methods are put forward.
Keywords： Bioinformatics; biology; teaching method; course cross
0.概述
近年来，伴随着生命科学的快速发展，有关生物的数据逐渐增多，而分析手段也很多，产生了生物信息学这个概念。
生物信息学是由生物学与计算机科学、应用数学以及统计学等学科相互交叉而形成的一门新兴学科，它使用计算机和信息技术对生物信息数据进行采集、处理、存储、检索和分析，从而达到揭示相关数据中所蕴含的生物学意义的目的[1]。
为了快速有效地从海量的生物数据中获得所需信息，提高发现问题、解决问题的能力，在生物信息学教学过程中有必要开设一些计算机课程、数学及工程相关课程，这样可以启发学生综合运用数学、物理、工程科学和计算机知识的能力，拓宽其知识面，了解学科前沿和最新进展，培养跨越生命科学、计算科学、数理科学等不同领域的大科学素质和意识，为今后选择新兴交叉学科领域进行深造奠定基础。
因此很多大学增设了生物信息学这个本科专业，有的在计算机学院中增加生物信息专业本科，有的在生命学院增加生物信息本科，在本文中主要讨论在生命学院中开始生物信息学专业。
作为一门交叉学科，不同专业的学科体系对生物信息学课程教学提出了不同的要求，如何在生物专业学生中开展生物信息与计算机课程的结合，是培养更高理论和实践能力的生物信息专业人才的关键。
1 生物信息学的特点
生物信息学涉及分子生物学、微生物学、生物化学、蛋白质化学、分子遗传学、基因组学、生物物理学、概率论与数理统计、信息论及计算机技术等学科，学科交叉性极强。
仅就计算机技术而言，计算机编程、数据库技术和模式识别、软件工程及网络技术等都在生物信息学中有广泛的应用[1，2]。
因此，生物信息学是将不同领域知识高度集中的学科。
2 计算机课程的设置
对生物信息学来说，计算机技术就是一个工具，用来对生物数据进行处理。
工欲善其事，必先利其器，所以要做好数据的分析工作，必须让学生学好计算机课程，但更应该在生物信息学专业的教学计划中把计算机课程设置恰当，让学生受益[2]。
2.1 课程的选择顺序
生物信息学面对的是海量生物数据，所以首先需要学习使用编程工具，如JAVA或者C++语言或者Perl语言等编程工具，然后安排数据结构等课程对编程课程进行深入了解，后期安排数据库技术、数据挖掘等课程，方便学生进行实践应用。
2.2 教材和授课内容的合理选择
在学习生物的.学生中开设生物信息学专业，那么教材的选择应该兼顾学生的知识背景和学习兴趣，由于学生对蛋白、进化、蛋白质结构、基因序列有一些认识，但对计算机比较恐惧，因此计算机教材可选用比较简单、易懂的，如JAVA课程主要讲解编程思想，那么主要包括环境变量设置、语法和如何编程，那么选择教材时就选包括这些内容的教材就可以了，并在上课过程中，结合一些生物信息软件来讲解，激发学生的学习兴趣。
同时，选择适合的授课内容也是必不可少的环节：序列比对算法、基因识别算法、蛋白质结构预测、分子动力学模型及机器学习或模式识别算法在生物信息学中的应用等方面的内容，此外在大学初期也要加强数学、物理和计算机方面的基本知识的课程开设[2]。
能够从他们自己的知识体系出发， 阐述生物数据如何用计算机方法和技术进行获得并处理;并且了解学生已经掌握哪些生物学知识，在授课过程中，针对学生的特点综合使用多本教材更能达到预期效果。
使学生认识到计算机技术和方法在生物学研究领域的广阔应用空间。
随着生物信息学研究的深入，国内外出现了大量的生物信息学教材、专著和一些最新的文献。
2.3从抽象到具体的教学理念
由于生物信息学涉及数学、统计学及算法等众多理论知识，但有生物基础的学生具有生物学知识储备，缺乏计算机知识。
所以在为生物学专业上进行计算机课程时尽量采用结合实例进行讲解。
首先，针对生物学专业学生计算机知识薄弱的特点，尽可能将生物信息学问题转化为学生熟知领域的问题，例如，在讲解蛋白质二级结构预测时，可考虑学生学习过螺旋、折叠和无规则卷曲的特征，讲解模式识别算法预测二级结构的过程时用可采用一些模型如苹果等进行形象讲解更容易被学生接受了;其次，充分利用现代化教育技术及网络资源，对于未接触过计算机实验学生来说，程序代码对于他们而言是枯燥无味的，在教学过程中充分利用计算机实验和网络资源，让学生了解计算机程序的运行过程和网络中生物信息软件的使用，从而对计算机处理生物学数据产生感性认识。
例如，在讲解利用聚类算法分析基因芯片数据时，可以先播放基因芯片制作过程的Flash动画，让学生身临其境，这样不仅可以激发学生的学习兴趣，更可以加深学生对知识的理解和掌握。
或者讲解聚类算法可以用物种分类进行类比来讲解[2]。
2.4加强实验环节
生物专业的生物信息学课程的教学过程就是让学生了解并掌握计算机科学和技术如何处理分析生物学数据的过程。
因此，进行理论教学的同时，实验教学环节也是必不可少的[3]。
计算机实验不同于生物实验，而是主要通过计算机进行处理，例如可通过计算机实验直观的了解三大核酸数据库：蛋白质序列和结构数据库的数据组织方式;通过实验可以让学生掌握如何利用Acclrys Discovery Stdio软件进行蛋白质结构预测，感受蛋白质结构显示软件的强大威力，更重要的是，使学生了解到计算机技术和方法在生物数据处理过程中的举足轻重的作用。
从生物信息学实验课中，他们可以领略到计算机科学技术的魅力，增加作为生物信息学专业学生的自豪感，并坚定学好生物信息学知识的信念。
3 后续课程的构想
在后续课程中，由于前面为学生设置数据库原理与设计及数据挖掘等课程，可开设一些专题讲座，如了解数据库设计后，可结合生物专业的特点，可能了解了在网络环境中三大核酸数据库的组织结构，讲解它们是如何采用数据库知识进行组织的，并进行一些简单数据库的设计工作;在数据挖掘课程后可采用一些统计学软件如MATLAB处理生物数据的一些专题[4，5]。
又如开设讲解生物信息学的研究热点与与原来讲解的课程进行对接。
也可讲解一下药物信息学的设计、疾病靶点的选择等，激发学生学习生物信息学的意义，让有可能进一步深造的学生知道前进的动力。
4 结束语
作为一门新兴的学科，生物信息学专业的发展非常迅速，新的理论、算法和应用程序不断涌现。
因此在进行生生物信息学专业教学中，不拘泥于现有的生物信息学教材和计算机教材时纳入最新的研究成果，将相关研究领域的一些新的研究方法、网络资源以及工具软件介绍给学生。
例如， GCG软件是一套蛋白质、核酸序列分析软件，一般在Linux环境下使用，包括130多个软件，但现在这些类似功能的软件很多可网络上下载到Windows系统环境下进行蛋白质、核酸序列分析，因此可介绍这些软件给同学使用，方便同学在自己的电脑里熟练使用这些软件，同时有些软件有更新的算法和版本也可以介绍，及时更新学生的知识体系，培养学生相关学科前沿的意识，拓展学生视野。
参考文献：
[1] 孙啸，陆祖宏，谢建明.生物信息学基础[M].北京：清华大学出版社，2005：3
[2] 丁彦蕊，蔡宇杰.计算机专业生物信息学课程教学的实践探讨，安徽农业科学，，40(29)14596-14597
[3] 高亚梅，韩毅强.生物信息学本科教学初探[J].生物信息学，，5(1)：44-48
[4] 戴凌燕，姜述君，高亚梅.《生物信息学》课程教学方法探索与实践[J].生物信息学，，7(4) ：311～313.
[5] David W M.Bioinformatics：sequence and genome analysis影印本[M].科学出版社，.
生物信息学专业就业方向
生物信息学是将计算机与信息科学技术运用到生命科学尤其是分子生物学研究中的重大交叉学科前沿研究领域。未来几年，这一学科的人才将成为国际、国内最紧缺的人才类型之一。生物信息学专家、天津大学的张春霆院士指出，运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大量基因组研究所获得的数据中所包含的生物学意义，生物学和信息学交叉、结合，从而形成的一个新的学科――生物信息学或信息生物学，它的进步所带来的效益是不可估量的。美国已经出现了大批基于生物信息学的公司，希冀在基因工程药物、生物芯片、代谢工程等领域掘出财富。生物信息工业潜力巨大。
在生物学家看来，存在于基因组中的.遗传序列是宝贵的生物信息资源，和他们所掌握的生物技术一样，是未来生物产业的支柱。科学家们认为人类10万个基因的信息以及相应的染色体位置被阐明后，将成为医学和生物制药产业知识和技术创新的源泉。从目前研究来看，一些困扰人类健康的主要疾病，例如心脑血管疾病、糖尿病、肝病、癌症、老年痴呆症等都与基因有关，可以依据已知的基因序列和功能，找出这些基因并针对相应的靶位进行药物筛选，甚至基于已有的基因知识来设计新药。生物信息资源孕育的巨大商业利益是不言自明的，这驱使众多的私人公司加入到了基因组研究的行列。其中最具代表性的是由美国著名基因组专家范特与著名生物仪器公司珀金埃尔默(PE)公司联手、两年前成立的塞莱拉基因公司。4月6日，该公司率先宣布绘制出了取自一个人的基因组图谱，此次又与政府资助的研究机构一起宣布了人类基因组工作框架图绘制的完成。基因组研究的商业阵营与政府资助的公益阵营之间的竞争进入了白热化阶段，而私营公司的介入才真正使基因组研究的进程搅动了股市。
日益激烈的竞争带来了新的挑战，同时加快了研究的进程，推动了技术的发展。科学家们预测：至少在今后5年内，基因组测序能力将以指数方式迅速上升，甚至超过信息产业中著名的摩尔定律所描述的速度。这是否意味着生物技术能够立刻就代替信息产业成为牵引经济发展的新动力呢？国家人类基因组南方中心主任陈竺院士认为，目前的人类基因组研究尚处在基础研究阶段，其成果能够直接应用于临床治疗或制药还需假以时日，以现在的研究进程看大约要20～30年之后，当然，也不排除有创新的技术出现而加快这个进程，不过最快也要在5～后。也就是说，生物技术类公司想大把大把地赚钱，从而领导新经济并不是眨眼之间的事。
一、在谈论学习方法之前，首先要明白三个观点：
1、学习生物要有兴趣。兴趣是学习的动力，是学习的第一位老师，有了兴趣，才会积极而愉快地投入，不会觉得学习是一种负担，歌德说：哪里没有兴趣，哪里就没有记忆。而我们生物是需要记忆的。兴趣从哪里来?所谓生物就是有生命的物体。我们人类就是一个活生生的生物体，你知道多少呢?DNA亲子鉴定、DNA指纹鉴定、DNA基因身份证、DNA到底是怎么回事?现在科技可以使树发光;使植物体内含有动物蛋白，人吃了这样的植物既能保证人的营养全面，又不会使人发胖。这到底是怎么回事呢?等等
2、要亲其师。古人云:亲其师信其道，如果一个学生喜欢这个老师，那么这个老师所教的这门功课成绩他肯定不会差。同学们老师虽然有些方面没有你们好，但他可以成为你们学习上的引路人,生活上的知心人。作为老师他肯定希望自己的学生好，正如你们的父母希望你们好一样,但老师又不同于你们的家长.你把老师当作你的好朋友，我想你们学习成绩的提高肯定没有问题。
3、我们要从高一抓起。高一是起点，是基础。打好基础，循序渐进，学习就不困难，就象登一座塔，看上去很高，有些怕，等到沿着阶梯一步步上来，其实并不困难。良好的开端是成功的一半。一步一个脚印，最后功到自然成。埋怨自己无能的人，正如刹了车埋怨车子不动，同学们每个人都可以成功。
二、那么怎样才能学好生物?
1、掌握规律
规律是事物本身固有的本质的必然的联系。生物有自身的规律，如结构与功能相适应、局部与整体相统一、生物与环境相协调，以及简单→复杂、低等→高等、水生→陆生的进化等。掌握这些规律将有助于生物知识的理解与运用，如线粒体学习就应紧抓结构与功能相适应的规律：有双层膜，内膜向内折迭形成嵴，扩大了膜面积，有利于有氧呼吸酶在其上有规律地排布;因而线粒体是有氧呼吸的主要场所。这样较易理解并记住其结构与功能。
2、观察比较
观察是一种有目的有计划的感知，不仅可以获得新知，也能验证已知。生物学是实验科学，观察是获得生物知识的重要环节。如观察生物的形态结构、生活习性、生长发育等等，有效地发挥观察在生物学学习中的作用。而我们生物学的原理、规律都是在观察实验的基础上得来的。
比较是认识事物的重要方法，有比较才有鉴别，生物中能比较的东西很多，如动物细胞与植物细胞、光合作用与呼吸作用、冬眠与夏眠等等。比较时注意对比较对象全面了解，然后确定比较项目，并做到简明扼要，如光合作用与呼吸作用这两类生理过程，可从场所、条件、过程、结果、意义等进行全面了解。通过比较有利于理解光合作用，呼吸作用的实质。中学生物概念多，易混难记，比较是有效的方法之一。
3、综合归纳
教师授课尤其是新授课，一般是分块的，但各块各知识点之间有内在的本质的联系，各年级生物知识是连贯的，是一个整体。学习时要将分散的知识聚集起来，归纳整理成为系统的知识，这样易理解好记忆。
综合归纳要做到“三抓”。一抓顺序、二抓联系、三抓特点。抓顺序就是要将各知识点按照本身的逻辑关系将其串联，如高中遗传的物质基础知识可按中心法则这一主线串联。抓联系，如神经细胞与脑、脊髓联系点在于神经细胞分细胞体、突起两部分，细胞体组成：脑、脊髓灰质等。抓特点，就是要抓重点抓主流。综合归纳不是眉毛胡子一把抓，不是大杂烩，应该将次要的东西简化甚至取消。
4、灵活运用
这是学好学活生物的关键，认识的目的全在于应用。灵活运用知识才能记得牢，学了才真正有用。运用知识解理论题或解决生产、生活中的实际问题，尤其是后者正是中学生薄弱环节，必须高度重视。如高中学了有丝__、减数__、弄清了这两种细胞__过程中染色体形态、数目行为的变化，运用这些知识就可用来判别有丝__与减数__图。学了生态学等知识在自家尝试建设生态小区，发展庭院经济等等。只要有心，生物无处不在，无处不用，定能学好，学活。
1、需掌握好的记忆方法
记忆是学习的基础，是知识的仓库，是思维的伴侣，是创造的前提，所以学习中依据不同知识的特点，配以适宜的记忆方法，可以有效地提高学习效率和质量。
记忆方法很多，下面仅举生物学学习中最常见的几种。
①简化记忆法即通过分析教材，找出要点，将知识简化成有规律的几个字来帮助记忆。例如DNA的分子结构可简化为“五四三二一”，即五种基本元素，四种基本单位，每种单位有三种基本物质，很多单位形成两条脱氧核苷酸链，成为一种规则的双螺旋结构。
②联想记忆法即根据教材内容，巧妙地利用联想帮助记忆。例如记微量元素：铁锰硼锌钼铜这六种元素，可以用谐音记忆铁猛碰新木桶，这样就记住了，而且不容易遗忘。
③对比记忆法在生物学学习中，有很多相近的名词易混淆、难记忆。对于这样的内容，可以运用对比法记忆。对比法即将有关的名词单独列出，然后从范围、内涵、外延乃至文字等方面进行比较，存同求异，找出不同点。这样反差明显，容易记忆。例如同化作用与异化作用、有氧呼吸与无氧呼吸、激素调节与神经调节、物质循环与能量流动等等。
④衍射记忆法此法是以某一重要的知识点为核心，通过思维的发散过程，把与之有关的其他知识尽可能多地建立起联系。这种方法多用于章节知识的总结或复习，也可用于将分散在各章节中的相关知识联系在一起。例如，以细胞为核心，要衍射出细胞的概念、细胞的发展、细胞的学说、细胞的种类、细胞的成分、细胞的结构、细胞的功能、细胞的__等知识。
2、形成良好的学习常规。
建立良好的学习常规，是学好生物学知识的重要保证，我们所说的学习常规，是指我们学习过程中必须注意的几个步骤，包括预习、听讲、复习和作业，总结等步骤。
①预习
预习是在老师讲课前，先浏览一遍讲课内容，在浏览时，应用笔将自己认为是重点的内容划出来，将自己看不懂的内容标出来，将浏览后产生的问题记下来，有能力、有条件的还可以自己做出预习笔记。通过这样的预习，为下一步听讲奠定基础，使自己的听讲更加有的放矢，听讲时就可以对自己已经弄懂的或重点知识重新加深印象，并比较一下老师的理解与自己的理解有什么差距，如果自己理解得不深，则可以进一步加深理解。对于自己预习时还不懂的问题，则是听讲的重要内容，一定要当堂弄清楚。对于在预习中产生的问题，如果老师讲到了，则要听懂，如果老师没有讲到，一定要向老师问清楚。预习也为将来的自学能力打下了良好的基础.
②听讲
很多优秀学生的经验都说明了一个共同点，即学生的主要功夫应下在课堂上。我们的学习过程，实际上是解决一种矛盾，即已知与未知的矛盾，通过学习把未知转化为已知，然后又有新的未知的出现，我们再来完成这个转化过程。而由未知转化为已知的过程是在课堂上，在老师的指导下完成的，因此应该是很顺利的。有很多学生就是课上认真听讲，在45分钟的时间里完成学习任务。但是，总有些人，课堂上不认真完成由未知向已知的转化，白白浪费掉45分钟，反而在课下再花时间去完成转化，此时已没有老师的指导，只有课本上的内容，显然是不会有好效果的。如此花双倍或更多的时间，去完成效果不好的学习任务，就是常说的事倍功半。只要我们把主要功夫下在课上，那么，课下的负担也就会减轻，而且学习效果也会提高，时间上也会更加充裕，这就是常说的事半功倍。所以，听讲这一步骤是极为关键的，那么，听讲时听什么?怎么听呢?
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