基于COⅡ基因序列的斑腿蝗科部分亚科的分子系统学研究

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基于COⅡ基因序列的斑腿蝗科部分亚科的分子系统学研究

篇1:基于COⅡ基因序列的斑腿蝗科部分亚科的分子系统学研究

基于COⅡ基因序列的斑腿蝗科部分亚科的分子系统学研究

采用PCR产物直接测序法测定了斑腿蝗科10个亚科16属22种的COⅡ基因585 bp的片段,对序列的碱基组成进行了分析,并评估了数据集的系统发育信号;最后,以癞蝗科的肃南短鼻蝗作为外群,采用NJ法、MP法、ML法以及贝叶斯推论法构建了系统树,以解决这些物种所代表的亚科之间的'系统发育关系.结果表明:22种斑腿蝗科昆虫的COⅡ基因序列碱基组成表现强烈的A+T含量偏向性.对COⅡ基因585 bp序列片段构成的全数据组和根据密码子不同位点划分的密码子第一、第二和第三位点数据组的系统发育信号分析显示,所有数据组都具有一定的系统发育信息.在4种方法得到的合一树中发现: (1)星翅蝗亚科、刺胸蝗亚科、黑背蝗亚科、斑腿蝗亚科的亲缘关系较近;(2)卵翅蝗亚科与稻蝗亚科亲缘关系较近,建议卵翅蝗亚科似乎应归入稻蝗亚科中,板胸蝗亚科与这两个亚科的关系较近;(3)黑蝗亚科和秃蝗亚科似乎应合并为一个亚科;(4)切翅蝗亚科的4个属未聚在一起,表明这些属的区别较大,不是一个单系群;(5)黑蝗亚科和秃蝗亚科关系较近,且与本研究中其他几个亚科的亲缘关系相对较远.研究结果表明COⅡ基因在解决斑腿蝗科的亚科以下属种间的系统发育关系时是一个有效的分子标记.

作 者:马兰 黄原 MA Lan HUANG Yuan  作者单位:陕西师范大学生命科学学院,西安,710062 刊 名:昆虫学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA ENTOMOLOGICA SINICA 年,卷(期): 49(6) 分类号:Q969 关键词:直翅目   斑腿蝗科   COⅡ基因   分子进化   系统发育  

篇2:基于线粒体COⅡ基因的中国蝽科分子系统学研究(半翅目,异翅亚目)

基于线粒体COⅡ基因的中国蝽科分子系统学研究(半翅目,异翅亚目)

扩增并测定了我国蝽科4亚科8属11种昆虫线粒体COⅡ基因585 bp的序列,对序列的碱基组成、转换颠换、遗传距离等进行分析,探讨了COⅡ基因在该科的分子进化机制.并基于COⅡ基因序列数据,分别采用邻接法(NI)、最大简约法(MP)和贝叶斯推论法(BI)建立蝽科分子系统发育关系.研究结果表明,蝽科昆虫COⅡ基因A+T含量平均为71.7%,存在较强的A+T含量偏向性,氨基酸的'变异率为27.2%;亚科间的遗传距离介于0.168~0.242之间,大于亚科内属种间的遗传距离,蝽科与盾蝽科2外群之间遗传距离最大,两科之间存在明显的间断.分子系统发育树表明,短喙蝽亚科为蝽科中较为原始的类群,分化较早,益蝽亚科与舌盾蝽亚科关系较近,形成一对姐妹群,蝽科中捕食性种类--益蝽亚科是较为特化的类群,它是由植食性种类分化而来.蝽科4亚科间的分子系统发育关系为Phyllocephalinae+(Pentatominae+(Asopinae+Podopinae).

作 者:卜云 栾云霞 郑哲民 BU Yun LUAN Yun-Xia ZHENG Zhe-Min  作者单位:卜云,BU Yun(中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海,32;陕西师范大学动物研究所,西安,710062)

栾云霞,LUAN Yun-Xia(中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所,上海,200032)

郑哲民,ZHENG Zhe-Min(陕西师范大学动物研究所,西安,710062)

刊 名:动物分类学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA ZOOTAXONOMICA SINICA 年,卷(期):2006 31(2) 分类号:Q96 关键词:半翅目   蝽科   分子系统学   线粒体COⅡ基因   中国  

篇3:斑腿蝗科Catantopidae七种蝗虫线粒体COⅠ基因的DNA条形码研

斑腿蝗科Catantopidae七种蝗虫线粒体COⅠ基因的DNA条形码研究

以我国常见的'斑腿蝗科Catantopidae 7种蝗虫为对象测定了COⅠ基因序列,探讨COⅠ基因作为DNA条形码在识别蝗虫物种方面的可行性.结果表明,斑腿蝗科3属7种的DNA分类和形态学分类基本一致,该基因可以探讨蝗虫属、种分类单元的系统发育问题,为将线粒体基因组的COⅠ基因作为蝗虫DNA条形码进行分类鉴定手段的可行性提供一定的参考.

作 者:潘程莹 胡婧 张霞 黄原 PAN Cheng-ying HU Jing ZHANG Xia HUANG Yuan  作者单位:陕西师范大学生命科学学院,陕西,西安,710062 刊 名:昆虫分类学报  ISTIC PKU英文刊名:ENTOMOTAXONOMIA 年,卷(期): 28(2) 分类号:Q969.26+5.1 关键词:直翅目   斑腿蝗科   COⅠ基因   DNA条形码  

篇4:基于CO Ⅰ基因部分序列对尾凤蝶属(鳞翅目,凤蝶科)四种蝴蝶分子系统关系

基于CO Ⅰ基因部分序列对尾凤蝶属(鳞翅目,凤蝶科)四种蝴蝶分子系统关系及相关问题的探讨

为了探讨中国尾凤蝶属的系统发生关系,对中国产4种尾凤蝶属蝴蝶的细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因的部分序列进行了分析.在获得的636bp的序列中,有59个变异位点,47个简约信息位点;A、T、G、C碱基的平均含量分别为29.5%、40.8%、13.9%及15.8%;表现出明显的A+T含量(70.3%)偏异.采用NJ、MP、ML法构建了分子系统树,结果表明尾凤蝶属二尾种组与多尾凤蝶亲缘关系较近,而三尾凤蝶较早分化出来.同时结果表明丽斑尾凤蝶和二尾凤蝶的COⅠ基因没有序列差异.对这2个物种3个个体的'COⅡ基因进行了测序,结果也没有序列的差异,表明丽斑尾凤蝶和二尾凤蝶可能是同物异名.而三尾凤蝶的遗传多样性较为贫乏.

作 者:诸立新 吴孝兵 晏鹏 ZHU Li-Xin WU Xiao-Bing YAN Peng  作者单位:诸立新,ZHU Li-Xin(安徽师范大学生命科学学院,芜湖,241000;安徽滁州学院化学生物系,滁州,239012)

吴孝兵,晏鹏,WU Xiao-Bing,YAN Peng(安徽师范大学生命科学学院,芜湖,241000)

刊 名:动物分类学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA ZOOTAXONOMICA SINICA 年,卷(期):2006 31(1) 分类号:Q966 关键词:鳞翅目   凤蝶科   尾凤蝶属   COⅠ基因   系统发生   遗传多样性  

篇5:叶甲科部分种类 Cyt b基因序列及系统发育关系初探

叶甲科部分种类 Cyt b基因序列及系统发育关系初探

测定分析了叶甲科 (Chrysomelidae)15 种昆虫mtDNA_Cyt b基因部分序列,结果显示,在获得的390 bp序列中,198个核苷酸位点为多态性位点(约占50.8%),序列间碱基差异平均值为18.9%,A+T含量为72.7%,碱基转换呈现明显的TC偏向性,颠换主要以TA为主,转换/颠换(R)值为0.8.依据分子数据建立了该 15种昆虫的系统发育关系,结果表明:跳甲亚科(Alticinae)和叶甲亚科(Chrysomelinae)的亲缘关系较近,萤叶甲亚科(Galerucinae)与前两者的关系较远.萤叶甲亚科中瓢萤叶甲为最早分化的类群,长跗萤叶甲属(Monolepta)、凹翅萤叶甲属(Paleosepharia)、长刺萤叶甲属(Atrachya)能形成姊妹群.克萤叶甲属(Cneorane)和守瓜属(Aulacophora)的亲缘关系较近.基于蛋白质序列构建的.系统树的置信值高于核苷酸序列建立的系统发育树.

作 者:方雪梅 聂晓萌 黄菲 郑哲民 FANG Xue-mei NIE Xiao-meng HUANG Fei ZHENG Zhe-min  作者单位:方雪梅,FANG Xue-mei(宿州学院,生化系,安徽,宿州,234000;陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)

聂晓萌,黄菲,郑哲民,NIE Xiao-meng,HUANG Fei,ZHENG Zhe-min(陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)

刊 名:华北农学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA 年,卷(期): 21(6) 分类号:Q969 关键词:鞘翅目   叶甲科   mtDNA-Cyt b   系统发育关系  

篇6:27种瓢虫mtDNA-COI基因序列分析及系统发育研究(鞘翅目:瓢虫科)

27种瓢虫mtDNA-COI基因序列分析及系统发育研究(鞘翅目:瓢虫科)

将自测的瓢虫科4亚科16种和从GenBank中检索到相关物种的mtDNA-COI基因编码区序列片断进行同源性比较,计算核苷酸使用频率,并构建分子系统树.在获得的471bp序列中,共有227个变异位点,195个简约信息位点,A+T约占66.7%,转换发生比颠换更频繁.分子系统树表明:同种和同属的`瓢虫均以较高置信值聚在一起,4个亚科都能恢复为单系;食植瓢虫亚科从系统树的基部最早分出,是瓢虫科最为原始的类群,小毛瓢虫亚科和盔唇瓢虫亚科首先聚为一支,显示二者具有较近的亲缘关系,然后再与瓢虫亚科相聚,食植瓢虫亚科的食植瓢虫属和裂臀瓢虫属均不是单系群.

作 者:付景 张迎春 FU Jing ZHANG Ying-chun  作者单位:陕西师范大学生命科学学院,陕西,西安,710062 刊 名:昆虫分类学报  ISTIC PKU英文刊名:ENTOMOTAXONOMIA 年,卷(期):2006 28(3) 分类号:Q969.496.8 关键词:鞘翅目   瓢虫科   mtDNA   COI   系统发育  

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