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依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系
盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群.我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae).研究测定了在我国采集到的'4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(ITS rDNA)序列,并分别采用邻接法和最大似然法构建分子系统发育树.结果显示,这4种盾腹吸虫的ITS-1和ITS-2序列的长度分别在728-877 bp和518-645 bp之间,其G+C含量分别在50.1%-52.3%和49.2%-52.2%范围内.4种盾腹吸虫的种间遗传距离在0.2%-26.9%之间,其中重庆盾腹吸虫(Aspidogaster chongqingensis)和似螺盾腹吸虫(A.limacoides)间仅为0.2%.所构建的最大似然树和邻接树具有相同的拓扑结构,均支持重庆盾腹吸虫和似螺盾腹吸虫亲缘关系最近,它们与饭岛盾腹吸虫(A.ijimai)亲缘关系较近,而与位于系统树基部的贝居盾腹吸虫(A.conchicola)关系较远.此外,对我国盾腹属种类的宿主特异性进行了讨论.
作 者：陈明秀 张立强 文春根 孙军 高谦 CHEN Ming-Xiu ZHANG Li-Qiang WEN Chun-Gen SUN Jun GAO Qian 作者单位：陈明秀,CHEN Ming-Xiu(华中农业大学水产学院,武汉,430070;中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072)张立强,高谦,ZHANG Li-Qiang,GAO Qian(中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072)
文春根,WEN Chun-Gen(南昌大学生命科学学院,南昌,330047)
孙军,SUN Jun(暨南大学水生生物研究所,广州,510632)
刊 名：水生生物学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 34(2) 分类号：Q349~+.13 关键词：ITS rDNA 盾腹属 系统发育关系 宿主特异性 ITS rDNA Aspidogaster Phylogenetic relationship Host specificity叶甲科部分种类 Cyt b基因序列及系统发育关系初探
测定分析了叶甲科 (Chrysomelidae)15 种昆虫mtDNA_Cyt b基因部分序列,结果显示,在获得的390 bp序列中,198个核苷酸位点为多态性位点(约占50.8%),序列间碱基差异平均值为18.9%,A+T含量为72.7%,碱基转换呈现明显的TC偏向性,颠换主要以TA为主,转换/颠换(R)值为0.8.依据分子数据建立了该 15种昆虫的系统发育关系,结果表明:跳甲亚科(Alticinae)和叶甲亚科(Chrysomelinae)的亲缘关系较近,萤叶甲亚科(Galerucinae)与前两者的关系较远.萤叶甲亚科中瓢萤叶甲为最早分化的类群,长跗萤叶甲属(Monolepta)、凹翅萤叶甲属(Paleosepharia)、长刺萤叶甲属(Atrachya)能形成姊妹群.克萤叶甲属(Cneorane)和守瓜属(Aulacophora)的亲缘关系较近.基于蛋白质序列构建的.系统树的置信值高于核苷酸序列建立的系统发育树.
作 者：方雪梅 聂晓萌 黄菲 郑哲民 FANG Xue-mei NIE Xiao-meng HUANG Fei ZHENG Zhe-min 作者单位：方雪梅,FANG Xue-mei(宿州学院,生化系,安徽,宿州,234000;陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)聂晓萌,黄菲,郑哲民,NIE Xiao-meng,HUANG Fei,ZHENG Zhe-min(陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)
刊 名：华北农学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA 年，卷(期)： 21(6) 分类号：Q969 关键词：鞘翅目 叶甲科 mtDNA-Cyt b 系统发育关系基于nrDNA ITS 序列数据的兰属系统发育关系的初步分析
现存的兰属分类系统是基于宏观形态学性状、尤其是花粉块的数目以及唇瓣与蕊柱的愈合程度而建立的.兰属因此而划分为3个亚属:兰亚属 (subgenus Cymbidium),大花亚属(subgenus Cyperorchis) 和建兰亚属 (subgenus Jensoa).本文运用PCR扩增和直接测序的方法分析兰属 (Cymbidium) 27种、3个栽培品种以及3个外类群的核DNA ITS 区段序列.通过最简约性分析产生的ITS系统发育树表明,兰属的3个亚属均可能为不自然的类群.大花亚属表现为一复系群,兰亚属的冬凤兰 (C.dayanum) 隐藏于其中;建兰亚属为一并系群,它的成员之一兔耳兰 (C.lancifolium) 偏离出去而成为兰属一最基部的分支;兰亚属为一复系群,它分为几支而分别与另两个亚属组合在一起.由于兰属ITS序列位点变异率较低,最简约性分析产生的几支主要分支均得不到Bootstrap分析的`高度支持,各亚属内组之间的关系也不明确.研究兰属的系统发育关系还需要新的数据.
作 者：张明永 孙彩云 郝刚 叶秀 梁承邺 朱光华 作者单位：张明永,孙彩云,郝刚,叶秀,梁承邺(中国科学院华南植物研究所,广州,510650)朱光华(密苏里植物园,圣*路易斯,MO,63166-0299,美国)
刊 名：植物学报 ISTIC SCI英文刊名：ACTA BOTANICA SINICA 年，卷(期)： 44(5) 分类号：Q941+.2 Q949.71+8.43 关键词：兰属 兰科 系统发育 ITS Cymbidium Orchidaceae phylogeny ITS我国珠母贝属(Pinctada)主要种类亲缘关系的初步分析
采用核糖体DNA内部转录间隔子1(ITS 1)序列初步分析了珠母贝属8个种的亲缘关系.结果表明,ITS 1长度范围分布在402-474bp之间,大珠母贝的ITS 1序列最长,黑珠母贝的最短.作为外群的企鹅珍珠贝ITS 1长385bp.系统发育分析表明,所研究种类聚合成3个类群.类群I包括合浦珠母贝Pinctada fucata和覆瓦珠母贝P.imbricata.类群II包括白珠母贝P.albina、黑珠母贝P.nigra、长耳珠母贝P.chemnitzi和射肋珠母贝P.radiata,其中前2个种聚合成1枝,后两个种聚合成另一枝,分别形成两个亚群:类群IIA和类群IIB.类群III包括珠母贝P.margaritifera和大珠母贝P.maxima.类群IIA与类群IIB之间、类群III的'大珠母贝与珠母贝之间的遗传距离较近(0.080- 0.100),类群I与类群II之间遗传距离较远(0.250- 0.270),类群III与类群I和类群II之间的遗传距离最大(0.400- 0.570).类群I中我国的P.fucata和澳大利亚的P.imbricata之间遗传距离很小(0.000-0.013),而两者的种内遗传距离分别为0.002- 0.013和0.005,种内与种间遗传距离相重叠,表明P.fucata和P.imbricata应为同种.类群IIA的P.albina与P.nigra之间的遗传距离为0.013,可能为两个亚种.类群IIB中的P.radiata与P.chemnitzi之间的遗传距离只有0.005-0.007,而本研究的P.chemnitzi的ITS 1序列与GenBank中的P.chemnitzi的ITS 1序列高度一致,表明P.radiata的鉴别可能有误.
作 者：喻达辉 朱嘉濠 贾晓平YU Da-Hui CHU Ka-Hou JIA Xiao-Ping 作者单位：喻达辉,YU Da-Hui(中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300;香港中文大学生物系李福善海洋科学研究中心,沙田,香港)朱嘉濠,CHU Ka-Hou(香港中文大学生物系李福善海洋科学研究中心,沙田,香港)
贾晓平,JIA Xiao-Ping(中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300)
刊 名：海洋与湖沼 ISTIC PKU英文刊名：OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA 年，卷(期)：2006 37(3) 分类号：Q179.4 关键词：珠母贝属 内部转录间隔子 系统发育分析 亲缘关系